公共仪器平台区划1000平米空间建设培训规范、设备先进、全院共享、运维高效的大型仪器群落，面向院内外有偿提供19类大型仪器的上机服务，涵盖显微成像、流式细胞术、代谢物分析、组织切片、细胞及分子生物学相关分析仪器；并提供流式分析、分选，透射电镜制样、阅片，代谢物鉴定、精确分子量确定、代谢组学、空间代谢组学分析等技术服务。
平台仪器及技术服务均通过LIMS系统预约使用，收费标准遵循成本补偿和非盈利原则制定，按照《中日友好临床医学研究所开放共享平台收费标准（试行）》进行收费。平台现有负责人1名，仪器负责老师8名。定期开展先进仪器讲座、仪器操作培训、技术服务介绍等活动，并保障仪器日常运维及技术支持，为使用者提供高效优质的服务。
仪器平台负责管理一层超高分辨成像室、流式分析室、流式分选室、多组学实验室、电镜室;二层:标本处理室、分子克隆室;二层、三层:明场成像室、荧光成像室、免疫印迹室、基因扩增室中的仪器设备,可供研究者完成细胞、分子水平的各种检测。通过建设多组学平台,帮助研究者筛选不同实验组别间的差异物质,以探索疾病发病机制、药物治疗机制,或开发疾病辅助诊断的标志物。
