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遗传多样性重组近交系BXD小鼠
简介
BXD重组近交系小鼠(Recombinant Inbred,RI)是由雌性C57BL/6J(B6)和雄性DBA/2J(D2)两个近交系小鼠杂交,经过F2代后代再进行至少20代以上的兄弟姐妹交配培育而成。目前,BXD群体目前有150多个品系,是世界上规模最大、遗传资料最为详尽的哺乳动物遗传参考群体资源。
BXD小鼠拥有大约600万个常见的DNA变异,包括单核苷酸多态性(SNPs)、插入缺失(Indels)、简单重复序列(STRs)以及结构变异(SVs)等。BXD小鼠的主要特点包括:(1) 高度的遗传多样性:BXD品系展示了丰富的遗传变异,这些变异与人类种群中观察到的基因变异相似,可用于研究遗传易感性和复杂疾病。(2) 广泛的表型多样性:BXD小鼠群体适用于多种复杂生物学问题的研究。(3) 遗传背景的稳定性:这些小鼠群体经过严格的近交培育,保证了其遗传背景的长期稳定,适合长期研究和可重复性实验。(4) 丰富的基因型和表型数据:目前,150多个BXD品系已完成全基因组测序,鉴定出了约600万的SNP变异。此外,收集了超过10,000种不同表型数据。(5) 全面的组学数据:从BXD群体中已经产生了超过100套的转录组数据、多个蛋白质组和代谢组数据。这些数据涵盖了几乎所有主要器官,极大地推动了系统生物学研究,特别是在遗传学、疾病机制探索以及精准医学领域中。
中日友好医院于2022年从美国田纳西大学引进了98个BXD小鼠品系,成为目前中国唯一被授权使用BXD小鼠的单位。目前中日友好医院团队已经将BXD小鼠广泛运用于精准用药评价、衰老机制研究、代谢性疾病及糖尿病肾病等多领域的研究。通过整合BXD小鼠的基因组、表型及生理病理数据,研究人员能够发现与精准用药、和疾病相关的关键基因和信号通路,从而为这些疾病的药物靶点发现、发病机制研究以及精准用药提供了重要的科学线索。
BXD公共数据库
美国田纳西大学健康科学中心的Robert W. Williams和陆璐教授的研究团队基于BXD小鼠的研究,开发了GeneNetwork网站(https://genenetwork.org/)。该平台整合了BXD小鼠的基因型、表型以及多组学数据,研究者可以方便地访问、分析和定位特定基因和功能。这些特点使得BXD群体成为探索复杂生物学问题、疾病机制研究、药物靶点发现以及精准医学应用中的强大平台。
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关于合作
未来我们将期待与多团队合作,推动BXD小鼠用于疾病机制研究、药物靶点的发现、捕捉药物试验中的广泛反应、识别影响药物反应差异的遗传位点、开发直接筛选药效的自然疾病动物模型、开发药物靶点验证的自然基因敲除动物模型、生成疾病动物模型等工作,着重解决创新药研发平台中缺乏“一群鼠”去桥接“一群人”的卡脖子问题,为创新药成功研发奠定创新的平台。
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